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发信人: Oncogene (基因头), 信区: Biology
标 题: [合集] 大家谈一谈线虫吧
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Oct 28 12:31:27 2006), 站内
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repair (小和尚) 于 (Mon Sep 4 05:09:57 2006) 提到:
HHMI里做线虫的一把一把,做线虫做得可以点的相当一部分都是HHMI,比例太高了
这玩意,大家的看法,还有哪些方向是值得继续探索下去的?
传统的development,PCD,neuronscience,哪些是穷途末路,哪些又是正当道时?
新的领域,tumor,life span,前途如何?
用来做disease model,潜力又有多大?
大家可不可以畅所欲言啊?
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peoplem (kissss) 于 (Tue Sep 5 00:47:44 2006) 提到:
nice idea, channelrhodopsin:) if you have known the receptor for food
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
: Food :) My idea is to engineer in light as a strong attractant by genetic
: engineering...
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cnyy (tea) 于 (Mon Sep 4 11:02:35 2006) 提到:
什么是PCD?
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: HHMI里做线虫的一把一把,做线虫做得可以点的相当一部分都是HHMI,比例太高了
: 这玩意,大家的看法,还有哪些方向是值得继续探索下去的?
: 传统的development,PCD,neuronscience,哪些是穷途末路,哪些又是正当道时?
: 新的领域,tumor,life span,前途如何?
: 用来做disease model,潜力又有多大?
: 大家可不可以畅所欲言啊?
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leeky (╭∩╮（︶︿︶）╭∩╮) 于 (Mon Sep 4 11:07:24 2006) 提到:
apoptosis
【 在 cnyy (tea) 的大作中提到: 】
: 什么是PCD?
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lanceandfei (La Jolla的云彩) 于 (Mon Sep 4 18:45:58 2006) 提到:
i like worm too. i heard kang shen's talk at GRC last month, which was
fantastic.
it was about wnt's negative role in synaptogenesis. and functional data was
amazing.
he left in the middle of the meeting and i haven't chance talk to him. i
talked to his graduate student. i asked him whether there were modeling
people working on worms. he didn't know.
i think worm is the best organism so far for modeling study.
the reason is not just worms are simple. much more than that. strong genetic
tools in worms let modeling study could make more senses.
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
: I like worm neuroscience. I am working on that. I don't know about the
: others that much though.
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Greendragon (不打不相识) 于 (Mon Sep 4 20:36:37 2006) 提到:
河马大哥分享一下试验项目管理的心得吧
你是用计算机还是用笔记本来 追溯每个项目的进程，文献等等
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
: To quote my former advisor: I don't sleep. :)
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Greendragon (不打不相识) 于 (Mon Sep 4 19:15:37 2006) 提到:
how come you are working on cultured neurons, mouse genetics,
photostimulation, worms, modeling at the same time? I am so curious.
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
: I like worm neuroscience. I am working on that. I don't know about the
: others that much though.
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bambooo (竹子) 于 (Mon Sep 4 19:23:00 2006) 提到:
a big bull for sure
【 在 Greendragon (不打不相识) 的大作中提到: 】
: how come you are working on cultured neurons, mouse genetics,
: photostimulation, worms, modeling at the same time? I am so curious.
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Greendragon (不打不相识) 于 (Mon Sep 4 23:17:50 2006) 提到:
这个tip很好
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
: 我这方面不太行的. 我其实就是自己给自己写email. 读一片文章也写一封.
: gmail search很方便. 当然还是有原始的写下来的实验笔记.
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DaShagen (Unbearable lightness ) 于 (Mon Sep 4 20:37:24 2006) 提到:
i guess he will say just use my brain..hehe
【 在 Greendragon (不打不相识) 的大作中提到: 】
: 河马大哥分享一下试验项目管理的心得吧
: 你是用计算机还是用笔记本来 追溯每个项目的进程，文献等等
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aspirin (司马不光) 于 (Mon Sep 4 22:32:52 2006) 提到:
我做过果蝇和线虫，说实话相比较而言我不太喜欢线虫。
线虫的优点是生长周期短，而且线虫的stock可以放液氮里面，
不用像果蝇的stock那样经常需要照顾。
呵呵，个人觉得把线虫从plate上面挑起来这个操作就不如果蝇那么容易，
所以对于大规模操作来说，线虫比果蝇要累。
线虫雌雄同体，在遗传筛选方面有很大的优势，
但是同时线虫实在太小了，有时候要看到phenotype不是很容易，
需要在高倍镜下面看，所以有时候工作量会非常大。
另外，线虫透明是他的一个优点，但是由于透明，
在低倍镜下面很多时候一些phenotype给人感觉时隐时现，不太容易看得清楚。
另外线虫还有个致命缺点就是做转基因不容易，而且得到的转基因line也容易丢。
以上这些对线虫的印象很有可能和我做的线虫课题有关，
不一定客观，而且一定不全面，仅供参考。
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: 那它和fly比的话，做神经优势和劣势各在哪里呢？
: 你觉得神经领域什么方向，作为线虫来说，未来10-20年内会茂盛起来，
: 什么方向又会衰退下去？
: 还有哪些可能的问题，人们还没有考虑用线虫去做，而这又是有可能非常有效的手段，
: 就像
: 前面帖子提到的神经网络（如果他或她说的是对的话）
: 又有哪些现在无法回答的重要的神经领域的问题可能在以后的某个时刻在线虫里面得到
: 突破的可能性很大。（比如线虫会有意识么）
: 河马能不能先抛些玉器出来啊：）
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puppeteer (减肥中的河马) 于 (Mon Sep 4 22:38:15 2006) 提到:
transgenesis is trivial? I don't quite understand your comment. RNAi is
trivial too. My impression is that transgenesis is so trivial so that people
don't even use Gal-UAS system. The problem you mentioned with stable
integration exists. But it's not hard it seems?
I haven't done drosophila genetics first hand. So maybe drosophila is even
more trivial. Compared to mouse, worm is a blessing.
I think it really depends on the phenotype you are screening for. For me, it
's all GFP based, so transparency is really advantage for me.
【 在 aspirin (司马不光) 的大作中提到: 】
: 我做过果蝇和线虫，说实话相比较而言我不太喜欢线虫。
: 线虫的优点是生长周期短，而且线虫的stock可以放液氮里面，
: 不用像果蝇的stock那样经常需要照顾。
: 呵呵，个人觉得把线虫从plate上面挑起来这个操作就不如果蝇那么容易，
: 所以对于大规模操作来说，线虫比果蝇要累。
: 线虫雌雄同体，在遗传筛选方面有很大的优势，
: 但是同时线
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aspirin (司马不光) 于 (Mon Sep 4 22:57:46 2006) 提到:
我没有亲自做过转基因线虫，因为没做几个月线虫就转到果蝇去了。
根据我做线虫时候的耳闻，还有自己看的一些文献，
线虫转基因好像很少用同源重组，很多使用extra chromosome array，
而且转进去的基因经常被silent掉，有的时候extra chromosome上的GFP是好的，
可是感兴趣的基因已经被silent掉了。
这个也是我选择不在那里做线虫的一个原因。
当然跟老鼠比是要好得多了。
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
transgenesis is trivial? I don't quite understand your comment. RNAi is
trivial too. My impression is that transgenesis is so trivial so that people
don't even use Gal-UAS system. The problem you mentioned with stable
integration exists. But it's not hard it seems?
I haven't done drosophila genetics first hand. So maybe drosophila is even
more trivial. Compared to mouse, worm is a blessing.
I think it really depends on the phenotype you are screening for. For me, it
's all GFP based, so transparency is really advantage for me.
【 在 aspirin (司马不光) 的大作中提到: 】
: 我做过果蝇和线虫，说实话相比较而言我不太喜欢线虫。
: 线虫的优点是生长周期短，而且线虫的stock可以放液氮里面，
: 不用像果蝇的stock那样经常需要照顾。
: 呵呵，个人觉得把线虫从plate上面挑起来这个操作就不如果蝇那么容易，
: 所以对于大规模操作来说，线虫比果蝇要累。
: 线虫雌雄同体，在遗传筛选方面有很大的优势，
: 但是同时线虫实在太小了，有时候要看到phenotype不是很容易，
: 需要在高倍镜下面看，所以有时候工作量会非常大。
: 另外，线虫透明是他的一个优点，但是由于透明，
: 在低倍镜下面很多时候一些phenotype给人感觉时隐时现，不太容易看得清楚。
: ...................
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Greendragon (不打不相识) 于 (Mon Sep 4 23:17:50 2006) 提到:
这个tip很好
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
: 我这方面不太行的. 我其实就是自己给自己写email. 读一片文章也写一封.
: gmail search很方便. 当然还是有原始的写下来的实验笔记.
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peoplem (kissss) 于 (Mon Sep 4 23:39:36 2006) 提到:
aggregation and learning are far from conciousness ba..
【 在 ahche (啊且) 的大作中提到: 】
: defined cells and cell lineages.
: ------------------
: Bargmann is the guy to ask. but given some
strains
: like to stay seperately and some strains like to accumulate together, it
is
: unlikely there are no communications between worms. Bargmann also shown
: worms
: could "remember" which bacteria is toxic to them.
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fiath (迷猪) 于 (Mon Sep 4 23:25:42 2006) 提到:
i fu le you.
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
: 我这方面不太行的. 我其实就是自己给自己写email. 读一片文章也写一封.
: gmail search很方便. 当然还是有原始的写下来的实验笔记.
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ahche (啊且) 于 (Mon Sep 4 23:40:30 2006) 提到:
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
: 没什么玉, 倒有几块砖.
: 我觉得C elegans好处和坏处都是更简单. 当然有个大"坏处"就是C elegans是non-
: spiking.
-------------------------------------
----------
----- agree
: 我个人觉得C elegans神经网是呼之欲出, 我相信, 不出5-10年, 就会有象genomics那
: 样的数据出来, 比如, 刺激一个神经元, 然后看所有其他神经元的反应. 再加上
: anatomy和genetics, 就象eric davidson解transcriptional regulation那样解掉C
: elegans.
: 我觉得真正有意思的东西是完全从感觉到动作解掉一个比较复杂的行为, 比如说sex,
: classical learning, etc. 当然更重大的意义是搞出一整套怎么对付neural
network
: 的方法论. 我相信完全把这一套搞出来的人应该得一个nobel prize.
: ...................
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cipher (小咸菜--走不出去) 于 (Mon Sep 4 23:28:53 2006) 提到:
我有一阵子对线虫有兴趣，它的确是做imaging, neuroscience, sex
determination，cell polarity的好model. 而且lineage清楚，什么
都straightforward.于是就开始想，是做fish呢还是worm呢？结果被
同事老板一顿鄙视，说能做vertebrate就不要做invertebrate。后来
也发现worm field里面敌人很多，因为就那么几个可以研究的咚咚，
每个咚咚都有若干人挤破头，大家争来抢去的就成了仇人。
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: HHMI里做线虫的一把一把,做线虫做得可以点的相当一部分都是HHMI,比例太高了
: 这玩意,大家的看法,还有哪些方向是值得继续探索下去的?
: 传统的development,PCD,neuronscience,哪些是穷途末路,哪些又是正当道时?
: 新的领域,tumor,life span,前途如何?
: 用来做disease model,潜力又有多大?
: 大家可不可以畅所欲言啊?
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ahche (啊且) 于 (Mon Sep 4 23:39:40 2006) 提到:
【 在 aspirin (司马不光) 的大作中提到: 】
: 我做过果蝇和线虫，说实话相比较而言我不太喜欢线虫。
: 线虫的优点是生长周期短，而且线虫的stock可以放液氮里面，
: 不用像果蝇的stock那样经常需要照顾。
: 呵呵，个人觉得把线虫从plate上面挑起来这个操作就不如果蝇那么容易，
--------------------
pretty simple under disect
microscopy.
hard under GFP scope.
: 所以对于大规模操作来说，线虫比果蝇要累。
: 线虫雌雄同体，在遗传筛选方面有很大的优势，
: 但是同时线虫实在太小了，有时候要看到phenotype不是很容易，
-------------------------
reason should be there are only a few
visuable phenotypes
in worms.
: 需要在高倍镜下面看，所以有时候工作量会非常大。
: 另外，线虫透明是他的一个优点，但是ore than that. strong
genetic
: tools in worms let modeling study could make more senses.
: ...................
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peoplem (kissss) 于 (Mon Sep 4 23:32:47 2006) 提到:
说的有道理 这年头作线虫拿fund比老鼠fish难多了 hehe
【 在 cipher (小咸菜--走不出去) 的大作中提到: 】
: 我有一阵子对线虫有兴趣，它的确是做imaging, neuroscience, sex
: determination，cell polarity的好model. 而且lineage清楚，什么
: 都straightforward.于是就开始想，是做fish呢还是worm呢？结果被
: 同事老板一顿鄙视，说能做vertebrate就不要做invertebrate。后来
: 也发现worm field里面敌人很多，因为就那么几个可以研究的咚咚，
: 每个咚咚都有若干人挤破头，大家争来抢去的就成了仇人。
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ahche (啊且) 于 (Mon Sep 4 23:30:56 2006) 提到:
expect neurobiology.
RNAi is c.elegans is still hot.
stem cells and tumoriogenesis is next direction
perhaps viral model.
I guess use c.elegans as disease model will be great. Like insulin/life span,
Question for us is try to find your own direction.
given it is so easy to do classic genetics screening and genome wide
screening.
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: HHMI里做线虫的一把一把,做线虫做得可以点的相当一部分都是HHMI,比例太高了
: 这玩意,大家的看法,还有哪些方向是值得继续探索下去的?
: 传统的development,PCD,neuronscience,哪些是穷途末路,哪些又是正当道时?
: 新的领域,tumor,life span,前途如何?
: 用来做disease model,潜力又有多大?
: 大家可不可以畅所欲言啊?
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repair (小和尚) 于 (Mon Sep 4 23:35:27 2006) 提到:
嗯,综合asprin和你谈的,目前的观点大概就是:
作为遗传model而言,从技术角度来讲,线虫有优势和劣势,综合考虑似乎差不多,不好不
坏.
从科学问题角度来讲,线虫有简单的优势,可能人们的想法在线虫身上更容易转化为一个
可以求证的科学问题;同样,劣势就是你只能选择性的回答一些科学问题(其实,这也不是
什么劣势,没有什么model上可以回答所有的问题,除了人,个人觉得).
至于一些表型不容易观测,这可能和你怎么利用遗传model有关,先gene后表型的确有这
样的问题,但这从来就不是遗传model的长处,而且有时候可以通过一些巧妙的实验来弥
补.相对mouse而言,fly一样有很多表型无法研究,所以还是体现在科学问题的选择范围
上.
另外,如asprin所言,我觉得透明是一个很重要的优势,以后可不可以在线虫里做单分子
标记,看看个体的环境下一些分子的行为是怎么回事?事实上发育,凋亡的研究很大程度
上都得益于透明这个因素.
简单又透明,怎么听上去象句歌词?
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
没什么玉, 倒有几块砖.
我觉得C elegans好处和坏处都是更简单. 当然有个大"坏处"就是C elegans是non-
spiking.
我个人觉得C elegans神经网是呼之欲出, 我相信, 不出5-10年, 就会有象genomics那
样的数据出来, 比如, 刺激一个神经元, 然后看所有其他神经元的反应. 再加上
anatomy和genetics, 就象eric davidson解transcriptional regulation那样解掉C
elegans.
我觉得真正有意思的东西是完全从感觉到动作解掉一个比较复杂的行为, 比如说sex,
classical learning, etc. 当然更重大的意义是搞出一整套怎么对付neural network
的方法论. 我相信完全把这一套搞出来的人应该得一个nobel prize.
意识听起来比较玄呀, 不知道线虫有没有.
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: 那它和fly比的话，做神经优势和劣势各在哪里呢？
: 你觉得神经领域什么方向，作为线虫来说，未来10-20年内会茂盛起来，
: 什么方向又会衰退下去？
: 还有哪些可能的问题，人们还没有考虑用线虫去做，而这又是有可能非常有效的手段，
: 就像
: 前面帖子提到的神经网络（如果他或她说的是对的话）
: 又有哪些现在无法回答的重要的神经领域的问题可能在以后的某个时刻在线虫里面得到
: 突破的可能性很大。（比如线虫会有意识么）
: 河马能不能先抛些玉器出来啊：）
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ahche (啊且) 于 (Mon Sep 4 23:34:10 2006) 提到:
in c.elegans, some people try to model Muv phenotype.
Given there are so few cells participitate in this process, maybe its Vulva
is the smallest "organ".
it is pretty clear about genes determine Muv, and gene-gene interaction
and cell-cell interactions.
to modeling neuronetwork, it may takes more time to figure out how many
elements
you need first.
【 在 lanceandfei (La Jolla的云彩) 的大作中提到: 】
: i like worm too. i heard kang shen's talk at GRC last month, which was
: fantastic.
: it was about wnt's negative role in synaptogenesis. and functional data
was
: amazing.
: he left in the middle of the meeting and i haven't chance talk to him. i
: talked to his graduate student. i asked him whether there were modeling
: people working on worms. he didn't know.
: i think worm is the best organism so far for modeling study.
: the reason is not just worms are simple. much m
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peoplem (kissss) 于 (Tue Sep 5 00:25:53 2006) 提到:
nice...我也有类似想法 不过现在距离我有实验室还非常遥远……
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
: my tentative thinking is to have my mouse part feed my worm part.
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ahche (啊且) 于 (Tue Sep 5 00:54:59 2006) 提到:
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: 现在关于tumor的知识,多半是基于tumor cell culture,即使现在逐渐转移到
: 小鼠上做tumor,其实多半也是观察某些分子在体内的tumor表型,并不涉及
: cell-cell communication,所以,说人们在做tumor cell,而不是tumor.
: 如果在线虫里面做这个,也就是说,并不直接从分子着手,比如那个GLD-1,
: 而是直接从(比如vulva衍生出来的tumor)tumor cells之间或者和另一些性质不同
: 的细胞之间的相互作用着手.我觉得线虫透明好操作,到时候可以直接去处某个细胞,看
: 对其它tumor cell的影响.还可以设计巧妙的assay来分析哪些分子参与这个过程.
: 其实,类似的,比如metasis在fly里已经有人做了,只是我觉得如果能单独敲除身边的某
--------------------------
it is a mature tech in
worms.
: 些细胞会更爽,而且线虫里面的lineage也清楚,说不定有点什么帮助.
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ahche (啊且) 于 (Tue Sep 5 00:51:53 2006) 提到:
for RNAi, there are so many off target effect, hard to reproduce,
neurons are resistant to RNAi.
RNAi is a good and easy way, but not a definitive way.
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
: But don't you just use RNAi? It seems much easier?
: mutations
: labs
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ahche (啊且) 于 (Mon Sep 4 23:57:38 2006) 提到:
from ShenKang and Bargamann's paper,
the worms are trained to eat a non-toxic bacteria and a toxic bateria,
and the worms can escape from that toxic bacteria next time.
does this fit the learning and memory theory?
:)
【 在 peoplem (kissss) 的大作中提到: 】
: I guess at least conciousness must be a generalized neural machinery, wh
: ich might influence multiple aspects of behaviors. For these behaviors w
: e are studying, such as Learning and memory, aggregation, it is kind of
: "specific" behavior with highly restricted input and output.
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repair (小和尚) 于 (Mon Sep 4 23:49:09 2006) 提到:
我一直在想,怎么利用线虫里面的细胞细胞之间的关系比较清楚且容易操作这个特点去
模拟tumor里的stroma和tumor cell的关系.
stem cell也有类似的问题,利用细胞之间的communication做model来研究一些问题倒是
很不错的
【 在 ahche (啊且) 的大作中提到: 】
: expect neurobiology.
: RNAi is c.elegans is still hot.
: stem cells and tumoriogenesis is next direction
: perhaps viral model.
: I guess use c.elegans as disease model will be great. Like insulin/life
span,
: Question for us is try to find your own direction.
: given it is so easy to do classic genetics screening and genome wide
: screening.
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ahche (啊且) 于 (Mon Sep 4 23:47:04 2006) 提到:
then the question is what is conciousness.
【 在 peoplem (kissss) 的大作中提到: 】
: aggregation and learning are far from conciousness ba..
: strains
: is
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ahche (啊且) 于 (Mon Sep 4 23:46:41 2006) 提到:
one important direction should use C.elegans to screen small molecular drug
libraries.
I guess some one from Schreiber's lab already begin this. But this is just
beginning.
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: 这是不是因为现在很多人做线虫,回答的问题不是那么令人感兴趣?
: 真要回答一些重要的且在线虫里做有绝对优势的问题,拿钱应该不是很难?
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repair (小和尚) 于 (Tue Sep 5 01:01:04 2006) 提到:
i know,所以我觉得这个很爽
【 在 ahche (啊且) 的大作中提到: 】
: --------------------------
: it is a mature tech in
: worms.
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peoplem (kissss) 于 (Tue Sep 5 00:24:49 2006) 提到:
It is classic conditioning, in which a conditioned stimulus (the non tox
ic bac) is associated with an unconditioned stimulus (the toxic bac). Th
is is well studied actually and we've known a lot about its molecular me
chanism. It is far from conciousness, I think.
【 在 ahche (啊且) 的大作中提到: 】
: from ShenKang and Bargamann's paper,
: the worms are trained to eat a non-toxic bacteria and a toxic bateria,
: and the worms can escape from that toxic bacteria next time.
: does this fit the learning and memory theory?
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ahche (啊且) 于 (Mon Sep 4 23:54:06 2006) 提到:
do u think the Vulva is a good model for tumor modeling,
given Ras, MAPK pathways are all there,
there are less than 10 cells you need take care.
it has hyperderma cells and VPC cells.
there should be several papers on this. Maybe u could find new angle.
a different opinion is that
how about use the GLD-1 strain as a model? given it is the best tumor model
in worms now.
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: 我一直在想,怎么利用线虫里面的细胞细胞之间的关系比较清楚且容易操作这个特点去
: 模拟tumor里的stroma和tumor cell的关系.
: stem cell也有类似的问题,利用细胞之间的communication做model来研究一些问题倒是
: 很不错的
: span,
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ahche (啊且) 于 (Mon Sep 4 23:43:09 2006) 提到:
【 在 cipher (小咸菜--走不出去) 的大作中提到: 】
: 我有一阵子对线虫有兴趣，它的确是做imaging, neuroscience, sex
: determination，cell polarity的好model. 而且lineage清楚，什么
: 都straightforward.于是就开始想，是做fish呢还是worm呢？结果被
: 同事老板一顿鄙视，说能做vertebrate就不要做invertebrate。后来
: 也发现worm field里面敌人很多，因为就那么几个可以研究的咚咚，
: 每个咚咚都有若干人挤破头，大家争来抢去的就成了仇人。
----------------------------------------------------------
worm commnunity is still OK bah compared with other field.
Given Brenner is still there.
You can screen whatever you like and stick to that.
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puppeteer (减肥中的河马) 于 (Tue Sep 5 00:28:20 2006) 提到:
I think the next big thing will be instrumental conditioning. That's my
first big experiment planned. Do you think worms will have instrumental
conditioning?
【 在 peoplem (kissss) 的大作中提到: 】
: It is classic conditioning, in which a conditioned stimulus (the non tox
: ic bac) is associated with an unconditioned stimulus (the toxic bac). Th
: is is well studied actually and we've known a lot about its molecular me
: chanism. It is far from conciousness, I think.
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ahche (啊且) 于 (Tue Sep 5 00:05:58 2006) 提到:
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
: That's true. But those can be integrated into the genome later on.
: Homologous recombination is for knock out?
-----------------------------
for site specific recombination to make mutations
to make knock out in c.elegans, it is much easier by mutageneisis. Two labs
provide these service and u can directly order strains from them.
: people
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puppeteer (减肥中的河马) 于 (Mon Sep 4 22:32:53 2006) 提到:
没什么玉, 倒有几块砖.
我觉得C elegans好处和坏处都是更简单. 当然有个大"坏处"就是C elegans是non-
spiking.
我个人觉得C elegans神经网是呼之欲出, 我相信, 不出5-10年, 就会有象genomics那
样的数据出来, 比如, 刺激一个神经元, 然后看所有其他神经元的反应. 再加上
anatomy和genetics, 就象eric davidson解transcriptional regulation那样解掉C
elegans.
我觉得真正有意思的东西是完全从感觉到动作解掉一个比较复杂的行为, 比如说sex,
classical learning, etc. 当然更重大的意义是搞出一整套怎么对付neural network
的方法论. 我相信完全把这一套搞出来的人应该得一个nobel prize.
意识听起来比较玄呀, 不知道线虫有没有.
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: 那它和fly比的话，做神经优势和劣势各在哪里呢？
: 你觉得神经领域什么方向，作为线虫来说，未来10-20年内会茂盛起来，
: 什么方向又会衰退下去？
: 还有哪些可能的问题，人们还没有考虑用线虫去做，而这又是有可能非常有效的手段，
: 就像
: 前面帖子提到的神经网络（如果他或她说的是对的话）
: 又有哪些现在无法回答的重要的神经领域的问题可能在以后的某个时刻在线虫里面得到
: 突破的可能性很大。（比如线虫会有意识么）
: 河马能不能先抛些玉器出来啊：）
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repair (小和尚) 于 (Mon Sep 4 20:52:41 2006) 提到:
那它和fly比的话，做神经优势和劣势各在哪里呢？
你觉得神经领域什么方向，作为线虫来说，未来10-20年内会茂盛起来，
什么方向又会衰退下去？
还有哪些可能的问题，人们还没有考虑用线虫去做，而这又是有可能非常有效的手段，
就像
前面帖子提到的神经网络（如果他或她说的是对的话）
又有哪些现在无法回答的重要的神经领域的问题可能在以后的某个时刻在线虫里面得到
突破的可能性很大。（比如线虫会有意识么）
河马能不能先抛些玉器出来啊：）
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
: I like worm neuroscience. I am working on that. I don't know about the
: others that much though.
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puppeteer (减肥中的河马) 于 (Tue Sep 5 01:02:23 2006) 提到:
I see. Thank you for the information. I didn't know neurons are resistant to
RNAi.
【 在 ahche (啊且) 的大作中提到: 】
: for RNAi, there are so many off target effect, hard to reproduce,
: neurons are resistant to RNAi.
: RNAi is a good and easy way, but not a definitive way.
☆─────────────────────────────────────☆
ahche (啊且) 于 (Mon Sep 4 23:38:13 2006) 提到:
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: 那它和fly比的话，做神经优势和劣势各在哪里呢？
defined cells and cell lineages.
: 你觉得神经领域什么方向，作为线虫来说，未来10-20年内会茂盛起来，
: 什么方向又会衰退下去？
: 还有哪些可能的问题，人们还没有考虑用线虫去做，而这又是有可能非常有效的手段，
: 就像
: 前面帖子提到的神经网络（如果他或她说的是对的话）
: 又有哪些现在无法回答的重要的神经领域的问题可能在以后的某个时刻在线虫里面得到
: 突破的可能性很大。（比如线虫会有意识么）
------------------
Bargmann is the guy to ask. but given some strains
like to stay seperately and some strains like to accumulate together, it is
unlikely there are no communications between worms. Bargmann also shown
worms
could "remember" which bacteria is toxic to them.
: 河马能不能先抛些玉器出来啊：）
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repair (小和尚) 于 (Tue Sep 5 01:08:27 2006) 提到:
mosaic可以解决一些问题,其实fly里早就有了,xutian用来做tumor,不过似乎
没出什么interesting resluts
mouse就是慢了些.不过,我也觉得其实在c.elegans里做tumor,只能做那些最
foundemental
的东西,再往下就没有多少人会buy the story了,可幸的是,tumor field现在还是一团
浆糊:)
【 在 heculase (似水年华) 的大作中提到: 】
: i think there is somebody from Luo's doing MACM in mice.
: that's pretty nice for tumor research and im sure he got a very nice offer
: for startup. i think the field would be again revolutionized in a few
years.
: before then, i have no interest in cancer at all. mosaic technique is so
: sophiscated that stem cells and tumors could be well studied at cellular
: level. the problem is still about cellular interaction. so people are
coming
: in this field, im not :)
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puppeteer (减肥中的河马) 于 (Mon Sep 4 22:24:22 2006) 提到:
我这方面不太行的. 我其实就是自己给自己写email. 读一片文章也写一封.
gmail search很方便. 当然还是有原始的写下来的实验笔记.
【 在 Greendragon (不打不相识) 的大作中提到: 】
: 河马大哥分享一下试验项目管理的心得吧
: 你是用计算机还是用笔记本来 追溯每个项目的进程，文献等等
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puppeteer (减肥中的河马) 于 (Tue Sep 5 00:16:49 2006) 提到:
单分子是个好想法, 我觉得.
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: 嗯,综合asprin和你谈的,目前的观点大概就是:
: 作为遗传model而言,从技术角度来讲,线虫有优势和劣势,综合考虑似乎差不多,不好不
: 坏.
: 从科学问题角度来讲,线虫有简单的优势,可能人们的想法在线虫身上更容易转化为一个
: 可以求证的科学问题;同样,劣势就是你只能选择性的回答一些科学问题(其实,这也不是
: 什么劣势,没有什么model上可以回答所有的问题,除了人,个人觉得).
: 至于一些表型不容易观测,这可能和你怎么利用遗传model有关,先gene后表型的确有这
: 样的问题,但这从来就不是遗传model的长处,而且有时候可以通过一些巧妙的实验来弥
: 补.相对mouse而言,fly一样有很多表型无法研究,所以还是体现在科学问题的选择范围
: 上.
: ...................
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puppeteer (减肥中的河马) 于 (Tue Sep 5 00:20:47 2006) 提到:
But don't you just use RNAi? It seems much easier?
【 在 ahche (啊且) 的大作中提到: 】
: -----------------------------
: for site specific recombination to make
mutations
: to make knock out in c.elegans, it is much easier by mutageneisis. Two
labs
: provide these service and u can directly order strains from them.
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peoplem (kissss) 于 (Tue Sep 5 00:47:44 2006) 提到:
nice idea, channelrhodopsin:) if you have known the receptor for food
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
: Food :) My idea is to engineer in light as a strong attractant by genetic
: engineering...
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peoplem (kissss) 于 (Mon Sep 4 05:57:20 2006) 提到:
我感觉线虫是个作神经网络得好东东 现在做的人太少了
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: HHMI里做线虫的一把一把,做线虫做得可以点的相当一部分都是HHMI,比例太高了
: 这玩意,大家的看法,还有哪些方向是值得继续探索下去的?
: 传统的development,PCD,neuronscience,哪些是穷途末路,哪些又是正当道时?
: 新的领域,tumor,life span,前途如何?
: 用来做disease model,潜力又有多大?
: 大家可不可以畅所欲言啊?
☆─────────────────────────────────────☆
peoplem (kissss) 于 (Mon Sep 4 05:57:20 2006) 提到:
我感觉线虫是个作神经网络得好东东 现在做的人太少了
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: HHMI里做线虫的一把一把,做线虫做得可以点的相当一部分都是HHMI,比例太高了
: 这玩意,大家的看法,还有哪些方向是值得继续探索下去的?
: 传统的development,PCD,neuronscience,哪些是穷途末路,哪些又是正当道时?
: 新的领域,tumor,life span,前途如何?
: 用来做disease model,潜力又有多大?
: 大家可不可以畅所欲言啊?
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puppeteer (减肥中的河马) 于 (Tue Sep 5 00:19:05 2006) 提到:
But how is it advantageous compared to cell culture. Do you imply
developmental defects etc?
【 在 ahche (啊且) 的大作中提到: 】
: one important direction should use C.elegans to screen small molecular
drug
: libraries.
: I guess some one from Schreiber's lab already begin this. But this is just
: beginning.
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peoplem (kissss) 于 (Mon Sep 4 23:23:49 2006) 提到:
嗯 跟我的想法差不多
然而有个问题就是，从神经元到行为，我感觉这个思路能且只能在线虫里用研究全
部神经元的方法来研究（最简单的 找到合适的活性Marker 直接看所有神经元在某
个行为中的活性。当然这里要求这个Marker时空分辨率都要比现有的高）
原因很简单，线虫神经元太少了，犯不着慢慢的去捉摸circuit和神经元之间的相互
调控 直接看 然后建模就行了。但是稍微高等一点的模式生物这个方法就完全不适
用，包括果蝇。果蝇有差不多10^4CNS神经元，这个数目不要说系统的看所有神经元
的活性的技术现在不现实，就算有了技术，建模也是大问题。因此可行的思路还是
得从circuit做起，慢慢积累神经元之间的功能联系再谈行为的网络基础。果蝇的这
个思路倒是适用于更高等的动物的。
我觉得还有一个很重要的问题就是利用线虫尝试改变神经网络的结构。这个现阶段
也只有线虫做得到了。我记得沈康在Bargamnn lab的一片cell有点这方面的提示
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
: 没什么玉, 倒有几块砖.
: 我觉得C elegans好处和坏处都是更简单. 当然有个大"坏处"就是C elegans是non-
: spiking.
: 我个人觉得C elegans神经网是呼之欲出, 我相信, 不出5-10年, 就会有象genomics那
: 样的数据出来, 比如, 刺激一个神经元, 然后看所有其他神经元的反应. 再加上
: anatomy和genetics, 就象eric davidson解transcriptional regulation那样解掉C
: elegans.
: 我觉得真正有意思的东西是完全从感觉到动作解掉一个比较复杂的行为, 比如说sex,
: classical learning, etc. 当然更重大的意义是搞出一整套怎么对付neural
network
: 的方法论. 我相信完全把这一套搞出来的人应该得一个nobel prize.
: ...................
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puppeteer (减肥中的河马) 于 (Tue Sep 5 00:10:05 2006) 提到:
是的. 但是我觉得从C elegans会出来一套理论, 怎么把整个network变成可相对分割的
小块.
这些数学工具对大一点的东西应该也会有用.
【 在 peoplem (kissss) 的大作中提到: 】
: 嗯 跟我的想法差不多
: 然而有个问题就是，从神经元到行为，我感觉这个思路能且只能在线虫里用研究全
: 部神经元的方法来研究（最简单的 找到合适的活性Marker 直接看所有神经元在某
: 个行为中的活性。当然这里要求这个Marker时空分辨率都要比现有的高）
: 原因很简单，线虫神经元太少了，犯不着慢慢的去捉摸circuit和神经元之间的相互
: 调控 直接看 然后建模就行了。但是稍微高等一点的模式生物这个方法就完全不适
: 用，包括果蝇。果蝇有差不多10^4CNS神经元，这个数目不要说系统的看所有神经元
: 的活性的技术现在不现实，就算有了技术，建模也是大问题。因此可行的思路还是
: 得从circuit做起，慢慢积累神经元之间的功能联系再谈行为的网络基础。果蝇的这
: 个思路倒是适用于更高等的动物的。
: ...................
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repair (小和尚) 于 (Tue Sep 5 00:45:18 2006) 提到:
现在关于tumor的知识,多半是基于tumor cell culture,即使现在逐渐转移到
小鼠上做tumor,其实多半也是观察某些分子在体内的tumor表型,并不涉及
cell-cell communication,所以,说人们在做tumor cell,而不是tumor.
如果在线虫里面做这个,也就是说,并不直接从分子着手,比如那个GLD-1,
而是直接从(比如vulva衍生出来的tumor)tumor cells之间或者和另一些性质不同
的细胞之间的相互作用着手.我觉得线虫透明好操作,到时候可以直接去处某个细胞,看
对其它tumor cell的影响.还可以设计巧妙的assay来分析哪些分子参与这个过程.
其实,类似的,比如metasis在fly里已经有人做了,只是我觉得如果能单独敲除身边的某
些细胞会更爽,而且线虫里面的lineage也清楚,说不定有点什么帮助.
【 在 ahche (啊且) 的大作中提到: 】
: ---------------------
: can u say it in more detail?
: 入.
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peoplem (kissss) 于 (Wed Sep 6 06:55:33 2006) 提到:
要仔细来看 这个所谓自我意识其实就是本体和客体的密切交流 比如说照镜子这个
动作，每个人照镜子之前其实都不知道自己长什么样，那为什么觉得镜子里的就是
自己 而不是一幅画？原因就是我能感觉到自己的本体动作 从而可以和镜子里面的
动作相印证，从而判断出那个是自己。说到本体感受这个应该是很低级的动物就有
，打个比方说果蝇腹部朝上就会挣扎着翻身 说明它能够感觉到自己的身体位置（好
像还有人做这个screen 找到的某一个mutant叫turtle 搞笑死了） 说到客体感受就
更加低级，只要视力不差的动物就能够看到镜子里的动作。那么问题就是他们为什
么没有能力把两者联系起来？是不是高等动物有专门的区域负责这种联系？我想如
果啥时候出现一个脑损伤病人 看见镜子就是不知道是谁 这个问题就解决了……（
或者有人在黑猩猩里面做过？我没跟踪过这方面的paper）
【 在 peoplem (kissss) 的大作中提到: 】
这么晚还不睡 hehe
我觉得迄今为止唯一一个让我相信确实是意识的动物实验 就是猩猩能够认出镜子里
面的是自己（比如说把它脸上画个点 他会照镜子擦掉） 这个实验可以令人信服的
表现出动物有自我意识 （如果没记错的话 似乎只有黑猩猩有这个能力 猴子和大猩
猩都没有） 别的所谓意识 大抵都是莫名其妙……
然而这个实验毫无疑问不能在worm作 hehe 我记得当年我和一个Labmate讨论作果蝇
的意识 他告诉我说 他觉得果蝇不可能有意识 原因是果蝇视力太差 就算给他镜子
他也看不出里面是什么 更不用说认出那个是自己 虽然是搞笑 也很有意思~
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
笛卡尔说,我思故我在,这个思算不算意识?
可不可以想办法知道线虫是否知道自己存在?如果能确定这个,是不是就可以说线虫有意
识.
【 在 peoplem (kissss) 的大作中提到: 】
: It is classic conditioning, in which a conditioned stimulus (the non tox
: ic bac) is associated with an unconditioned stimulus (the toxic bac). Th
: is is well studied actually and we've known a lot about its molecular me
: chanism. It is far from conciousness, I think.
☆─────────────────────────────────────☆
ahche (啊且) 于 (Tue Sep 5 00:16:18 2006) 提到:
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: 嗯,看上去不错:)
: 现在做得多一些的还是germ cell tumors,不过我觉得肯定有别的更好的model,至少要
: 涉及如你前面提到的器官.
: GLD-1,倒还不好说,p53 pathway看上去在mammalina里很不错,但我觉得它的重要性被夸
: 大了.线虫里面tumor的model,最好还是先从细胞层面着手比较好,不然没什么优势,因为
---------------------
can u say it in more detail?
: mammalian里面的研究基本上还是inside cells,即使angiogenesis的研究,也不够深
入.
: model
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heculase (似水年华) 于 (Tue Sep 5 03:48:50 2006) 提到:
如果只是做基础的话,果蝇上面的mosaic已经相当完备了.主要是做stem cell和相关的
interaction很好作,可以做很多种不同的screen.
虫子除了pcd和development,有没有更加有意思的领域就说不清了.毕竟它的神经元和高
等的有巨大不同.
如果是做imaging&RNAi manipulation of neurons不如做水母
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: 其实,我觉得还是fundemental的东西没有搞清楚,而genetic model对于tumor而言,
: 又不太可能诞生出fundemental的东东出来,因为本来就没有tumor,多数是模拟一下
: tumor的一些环境和行为,所以想搞点eye-catching的东西也有点难.
: 但是贡献一些pathway还是可以的,mice就是有mosaic也有个大缺陷,就是出东西慢.
: 对于象cell-cell communication这样的新领域,线虫还是可以贡献一些力量的.不过,
: 我也觉得,这样不够exacting,还是找些全新的东西来做,找些目前只能从线虫着手的
: 东西:)
: xu's work is not interesting basically because it's invetebrate.
: if that's in fish, would be interesting
: MACM is similar to xu's mosaic in principle, but applicable in mice also.
: ...................
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ahche (啊且) 于 (Tue Sep 5 00:51:53 2006) 提到:
for RNAi, there are so many off target effect, hard to reproduce,
neurons are resistant to RNAi.
RNAi is a good and easy way, but not a definitive way.
【 在 puppeteer (减肥中的河马) 的大作中提到: 】
: But don't you just use RNAi? It seems much easier?
: mutations
: labs
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peoplem (kissss) 于 (Wed Sep 6 06:46:24 2006) 提到:
这么晚还不睡 hehe
我觉得迄今为止唯一一个让我相信确实是意识的动物实验 就是猩猩能够认出镜子里
面的是自己（比如说把它脸上画个点 他会照镜子擦掉） 这个实验可以令人信服的
表现出动物有自我意识 （如果没记错的话 似乎只有黑猩猩有这个能力 猴子和大猩
猩都没有） 别的所谓意识 大抵都是莫名其妙……
然而这个实验毫无疑问不能在worm作 hehe 我记得当年我和一个Labmate讨论作果蝇
的意识 他告诉我说 他觉得果蝇不可能有意识 原因是果蝇视力太差 就算给他镜子
他也看不出里面是什么 更不用说认出那个是自己 虽然是搞笑 也很有意思~
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
笛卡尔说,我思故我在,这个思算不算意识?
可不可以想办法知道线虫是否知道自己存在?如果能确定这个,是不是就可以说线虫有意
识.
【 在 peoplem (kissss) 的大作中提到: 】
: It is classic conditioning, in which a conditioned stimulus (the non tox
: ic bac) is associated with an unconditioned stimulus (the toxic bac). Th
: is is well studied actually and we've known a lot about its molecular me
: chanism. It is far from conciousness, I think.
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repair (小和尚) 于 (Wed Sep 6 06:03:39 2006) 提到:
笛卡尔说,我思故我在,这个思算不算意识?
可不可以想办法知道线虫是否知道自己存在?如果能确定这个,是不是就可以说线虫有意
识.
【 在 peoplem (kissss) 的大作中提到: 】
: It is classic conditioning, in which a conditioned stimulus (the non tox
: ic bac) is associated with an unconditioned stimulus (the toxic bac). Th
: is is well studied actually and we've known a lot about its molecular me
: chanism. It is far from conciousness, I think.
☆─────────────────────────────────────☆
puppeteer (减肥中的河马) 于 (Tue Sep 5 00:16:49 2006) 提到:
单分子是个好想法, 我觉得.
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: 嗯,综合asprin和你谈的,目前的观点大概就是:
: 作为遗传model而言,从技术角度来讲,线虫有优势和劣势,综合考虑似乎差不多,不好不
: 坏.
: 从科学问题角度来讲,线虫有简单的优势,可能人们的想法在线虫身上更容易转化为一个
: 可以求证的科学问题;同样,劣势就是你只能选择性的回答一些科学问题(其实,这也不是
: 什么劣势,没有什么model上可以回答所有的问题,除了人,个人觉得).
: 至于一些表型不容易观测,这可能和你怎么利用遗传model有关,先gene后表型的确有这
: 样的问题,但这从来就不是遗传model的长处,而且有时候可以通过一些巧妙的实验来弥
: 补.相对mouse而言,fly一样有很多表型无法研究,所以还是体现在科学问题的选择范围
: 上.
: ...................
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heculase (似水年华) 于 (Tue Sep 5 00:52:38 2006) 提到:
i think there is somebody from Luo's doing MACM in mice.
that's pretty nice for tumor research and im sure he got a very nice offer
for startup. i think the field would be again revolutionized in a few years.
before then, i have no interest in cancer at all. mosaic technique is so
sophiscated that stem cells and tumors could be well studied at cellular
level. the problem is still about cellular interaction. so people are coming
in this field, im not :)
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: 现在关于tumor的知识,多半是基于tumor cell culture,即使现在逐渐转移到
: 小鼠上做tumor,其实多半也是观察某些分子在体内的tumor表型,并不涉及
: cell-cell communication,所以,说人们在做tumor cell,而不是tumor.
: 如果在线虫里面做这个,也就是说,并不直接从分子着手,比如那个GLD-1,
: 而是直接从(比如vulva衍生出来的tumor)tumor cells之间或者和另一些性质不同
: 的细胞之间的相互作用着手.我觉得线虫透明好操作,到时候可以直接去处某个细胞,看
: 对其它tumor cell的影响.还可以设计巧妙的assay来分析哪些分子参与这个过程.
: 其实,类似的,比如metasis在fly里已经有人做了,只是我觉得如果能单独敲除身边的某
: 些细胞会更爽,而且线虫里面的lineage也清楚,说不定有点什么帮助.
☆─────────────────────────────────────☆
repair (小和尚) 于 (Tue Sep 5 01:08:27 2006) 提到:
mosaic可以解决一些问题,其实fly里早就有了,xutian用来做tumor,不过似乎
没出什么interesting resluts
mouse就是慢了些.不过,我也觉得其实在c.elegans里做tumor,只能做那些最
foundemental
的东西,再往下就没有多少人会buy the story了,可幸的是,tumor field现在还是一团
浆糊:)
【 在 heculase (似水年华) 的大作中提到: 】
: i think there is somebody from Luo's doing MACM in mice.
: that's pretty nice for tumor research and im sure he got a very nice offer
: for startup. i think the field would be again revolutionized in a few
years.
: before then, i have no interest in cancer at all. mosaic technique is so
: sophiscated that stem cells and tumors could be well studied at cellular
: level. the problem is still about cellular interaction. so people are
coming
: in this field, im not :)
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heculase (似水年华) 于 (Tue Sep 5 01:05:44 2006) 提到:
there is a natural barrier to turn upon invetebrates from vetebrates. if you
have a mice model, few people take fly seriously. that's the problem with
xu tian's flies of cancer.
could you please explain the technique in worm or say some reference? im
quite interested in doing it for some other purposes *_^
【 在 peoplem (kissss) 的大作中提到: 】
: We can do similar things in worm, even without mosaic.
: years.
: coming
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repair (小和尚) 于 (Tue Sep 5 02:12:47 2006) 提到:
是的,他有一篇paper做的类似的东东.事实上,从治疗的角度来考虑,metastasis更
适合作为一个研究对象,相对于传统的tumor formation而言. 现在对于tumor
formation
这一块,有点希望的是tumor stem cell,不过现在证据还太少.
【 在 peoplem (kissss) 的大作中提到: 】
: Yes, I think Vulva is very good model for tumor, especially metastasis.
: I remember Paul Sternberg lab have several papers on that.
: model
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repair (小和尚) 于 (Tue Sep 5 00:10:44 2006) 提到:
嗯,看上去不错:)
现在做得多一些的还是germ cell tumors,不过我觉得肯定有别的更好的model,至少要
涉及如你前面提到的器官.
GLD-1,倒还不好说,p53 pathway看上去在mammalina里很不错,但我觉得它的重要性被夸
大了.线虫里面tumor的model,最好还是先从细胞层面着手比较好,不然没什么优势,因为
mammalian里面的研究基本上还是inside cells,即使angiogenesis的研究,也不够深入.
【 在 ahche (啊且) 的大作中提到: 】
: do u think the Vulva is a good model for tumor modeling,
: given Ras, MAPK pathways are all there,
: there are less than 10 cells you need take care.
: it has hyperderma cells and VPC cells.
: there should be several papers on this. Maybe u could find new angle.
: a different opinion is that
: how about use the GLD-1 strain as a model? given it is the best tumor
model
: in worms now.
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heculase (似水年华) 于 (Tue Sep 5 01:57:49 2006) 提到:
xu's work is not interesting basically because it's invetebrate.
if that's in fish, would be interesting
MACM is similar to xu's mosaic in principle, but applicable in mice also.
i think they use a different set of system rather than Gal80.
【 在 repair (小和尚) 的大作中提到: 】
: mosaic可以解决一些问题,其实fly里早就有了,xutian用来做tumor,不过似乎
: 没出什么interesting resluts
: mouse就是慢了些.不过,我也觉得其实在c.elegans里做tumor,只能做那些最
: foundemental
: 的东西,再往下就没有多少人会buy the story了,可幸的是,tumor field现在还是一团
: 浆糊:)
: years.
: coming
☆─────────────────────────────────────☆
peoplem (kissss) 于 (Mon Sep 4 23:51:58 2006) 提到:
I guess at least conciousness must be a generalized neural machinery, wh
ich might influence multiple aspects of behaviors. For these behaviors w
e are studying, such as Learning and memory, aggregation, it is kind of
"specific" behavior with highly restricted input and output.
【 在 ahche (啊且) 的大作中提到: 】
: then the question is what is conciousness.
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peoplem (kissss) 于 (Tue Sep 5 00:55:11 2006) 提到:
We can do similar things in worm, even without mosaic.
【 在 heculase (似水年华) 的大作中提到: 】
: i think there is somebody from Luo's doing MACM in mice.
: that's pretty nice for tumor research and im sure he got a very nice offer
: for startup. i think the field would be again revolutionized in a few
years.
: before then, i have no interest in cancer at all. mosaic technique is so
: sophiscated that stem cells and tumors could be well studied at cellular
: level. the problem is still about cellular interaction. so people are
coming
: in this field, im not :)
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repair (小和尚) 于 (Wed Sep 6 21:26:39 2006) 提到:
那瞎子怎么实现这种交流呢?
"我在"这个概念是不是可以说,我是我,我不是你,
所以说,如果在一个社会关系里,一个线虫如果能区别自己和其它线虫的角色是不是可以
说它有意识?
你说工蜂靠什么知道自己应该做工蜂该做的事,它为什么不会认为自己是个蜂后?
【 在 peoplem (kissss) 的大作中提到: 】
: 要仔细来看 这个所谓自我意识其实就是本体和客体的密切交流 比如说照镜子这个
: 动作，每个人照镜子之前其实都不知道自己长什么样，那为什么觉得镜子里的就是
: 自己 而不是一幅画？原因就是我能感觉到自己的本体动作 从而可以和镜子里面的
: 动作相印证，从而判断出那个是自己。说到本体感受这个应该是很低级的动物就有
: ，打个比方说果蝇腹部朝上就会挣扎着翻身 说明它能够感觉到自己的身体位置（好
: 像还有人做这个screen 找到的某一个mutant叫turtle 搞笑死了） 说到客体感受就
: 更加低级，只要视力不差的动物就能够看到镜子里的动作。那么问题就是他们为什
: 么没有能力把两者联系起来？是不是高等动物有专门的区域负责这种联系？我想如
: 果啥时候出现一个脑损伤病人 看见镜子就是不知道是谁 这个问题就解决了……（
: 或者有人在黑猩猩里面做过？我没跟踪过这方面的paper）
: ...................
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