发信人: exposure (曝光), 信区: Biology
标 题: Re: 请教几个molecular dynamics软件
发信站: Unknown Space - 未名空间 (Sun Nov 9 23:03:17 2003), 站内信件

all the force fields you listed are supported in namd.

【 在 Ag (小坡) 的大作中提到: 】
: 我想即使是namd的头也不敢象你这么大口气说话，呵呵。
: amber的force fields，模拟DNA是最强的，无可比拟。
: charmm的package比较大，分析处理数据，还有一些辅助分析手段比较完善一些。
: gromos gromacs不太清楚，后者好像是前者的衍生。
: NAMD好像比较新，没有了解。
: 我觉得没有所谓的活力前途比较一说，主要还是network的问题。
: karplus派系出来的人，多用charmm。kollman派系出来的，多用amber。
: 欧洲那边的，多用gromos。
: 【 在 exposure (曝光) 的大作中提到: 】
: : none of them. check out NAMD, a MD program optimized for parallel computing.


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※ 来源:．Unknown Space - 未名空间 mitbbs.com．[FROM: 12.221.]