发信人: vanLoon (房中之龙), 信区: Biology
标 题: Re: [转载] 钾通道水通道的结构解析真的终结争论了么？
发信站: Unknown Space - 未名空间 (Mon Nov 17 10:56:41 2003) WWW-POST

First, ion is translocated within the conducting duct as dehydrated form.
Theerefore the ion selectivity is actually determined by both protein and ion
properties.
The reaction can be simplified as (alkaline metal, for example; A stands for
the amino residue that binds to ion):

Li (H2O)n + A ---> LiA + nH2O

This reaction depends on:
1. dehydration energy of the hydrated ion, for which the order is: Li > Na > K
> Rb > Cs, determined mainly by the electric strength of naked ion. It is also
depicted as a saturated curve-like relationship.

2. binding energy of A and ion. This is complicated since your protein could
have internal and external context of either high or low field strength. The
curve among the ions is also saturated curve shape for specific protein.

The outcome, therefore the ion selectivity, is determined by the relationship
of the 2 curves 'cause the levels of these 2 are at odds.

Generally, under normal condition, K > Na > Rb > Cs > Li. But at high field
strength, the order would be: Li > Na > K > Rb > Cs while the reverse order
can be found at low field strength.



【 在 wonderlich (左岸，遁去) 的大作中提到: 】
: hydrated ion diameter.
: according to the book,
: hydrated K+: 3.8 A
: hydrated Na+: 5 A
:
: 【 在 leohawk (leohawk) 的大作中提到: 】
: : something wrong ba? I think diameter of K+ should be larger than Na+
: :
: : you said some chanel larger than K+, smaller than Na+ ???
: :
: : I don't know anything about those channels.
: :
: : what I heard, however, is that there is a plug at the channel, is that
: : true?
: :
: : 【 在 wonderlich (左岸，遁去) 的大作中提到: 】
: : : 【 以下文字转载自 Macromolecules 讨论区,原文如下 】
: : : 发信人: wonderlich (左岸，遁去), 信区: Macromolecules
: : : 标 题: 钾通道水通道的结构解析真的终结争论了么？
: : : 发信站: Unknown Space - 未名空间 (Sun Nov 16 03:09:38 2003) WWW-POST
: : : 今晚阅读了一本书的一章，
: : : 谈论细胞膜内外的钠钾离子浓度差别的问题，
: : : 其实也是最原始最基本却直到如今仍然没有得到解决的问题。
: : : 按照传统的chanel和pump的原理，
: : : 有不少致命的漏洞，
: : : 不计其数的离子种类造成了针对不同离子就需要构建不同的pump,
: : : 无论从size来说还是能量的消耗来说，
: : : 都是根本无法成立的。
: : : 而这个无法成立的pump理论是对于我们熟知的chanel的补充，
: : : 因为单纯chanel理论无法解释如果仅存在直径稍大于K+，
: : : 却小于Na+半径的chanel为什么仍会允许少量Na+的渗透。
: : : 在解决这个问题的过程中，
: : : 今年的Nobel奖并不是第一个获奖的，
: : : Erwin Neher & Bert Sakmann因为创造了patch-clamp技术，
: : : 并观测到chanel获得了Nobel奖。
: : : 具有讽刺意味的是，
: : : 那些被认为是chanel的信号在后来测量一般的没有chanel的聚合物膜也存在。
: : : 麦金农1998的那篇文章也被收录，
: : : 但似乎并没有被着重陈述，
: : : 似乎，
: : : 这个fundamental的问题，
: : : 实际上远远没有被认识清楚，
: : : 阿格里和麦金农的成就目前来说应该是重要的成就，
: : : 但很可能，仅仅是人类认识细胞膜function的一个小步而已。
: :
: :
:

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个人的不宽容只能以自由国家的大多数公民不介意为极限，不得超越。然而官方的不宽容
却不然，它可以权力浩大。它除自己的力量之外，不承认任何权威。官方的不宽容一旦胡
乱发起脾气，便可以置无辜的人于死地，也从不做任何反悔补救之事。它不要听任何辩解
，还求助于“神灵”来支持自己的决定，花言巧语辩解一番“天国”的旨意，似乎打开生
存之谜的思想是刚刚在大选中获胜的人的独有之物。


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