发信人: Geneporter (Geneporter), 信区: Biology
标 题: Re: 请问谁对做DNase footprinting有经验?
发信站: Unknown Space - 未名空间 (Sat May 22 23:12:10 2004) WWW-POST
哎....一个破footprint,还说得挺高深似的,你照分子克隆第三版的方法做就行了。我
才做过, 结果挺漂亮。你实验室的破石刀也太有趣了把, DNA测序胶就不能做了吗?我
们实验室有一段时间天天有人做测序胶啊,大家的结果都很漂亮的。这都很简单的。其实
科研中方法问题是最简单而且不重要的,关键是你能否用你得到的结果Make a good
story.
对了,你也可以用methylation interference. Gel shift assay 也挺好的呀,关键是要
解决你的问题,方法是其次的。顺便说以下, 即使你用footprint/methylation
interference,你也应该用Gel shift 再确认你的binding sequence specificity.
【 在 musician (自由心) 的大作中提到: 】
: people only show the best data they got - it might be the one
: they tried for 6 months
:
: generally, if your lab does not have established protocol, it won't
: be too easy.
:
:
: 【 在 ivytree (小pork) 的大作中提到: 】
: : 很想做一下。但我们实验室的博士后告诉我这个很难做。关键原因是读
: : 不清楚出来的胶图,因此也看不清楚保护的区域。不知道那位有经验的同
: : 志能给点指点?看到有些论文上发的footprinting做得叫一个清楚,实在是
: : 很有说服力。因此比较心动。我们实验室的人告诉我清楚的图是用DNA测
: : 序仪(测序胶)run的所以比较清楚blabla。
: : 还有假如这个方法现在已经不流行有没有什么更好的方法?except for
: : gel mobility shift. (实在不行我只能用这个)多谢指教。
:
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