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Re: 谁熟悉tet on/off system,请指点一下
[同主题阅读] [版面:生物学] [作者:sinister] , 2005年05月18日00:31:33
sinister
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发信人: sinister (@_@), 信区: Biology
标 题: Re: 谁熟悉tet on/off system,请指点一下
发信站: Unknown Space - 未名空间 (Wed May 18 00:35:24 2005), 站内信件

这两套系统不兼容的,别想了。我也琢磨过,
rtTA本身fused with VP16 activation domain,
没有doxycyclin, rtTA不能binding Tet-O,
so no block, H1 promoter work.
加了doxycyclin, 更完蛋了,rtTA本身就可以
驱动下游基因表达了。

【 在 smallbite (小咬) 的大作中提到: 】
: 我现在计划建一个inducible RNAi的细胞系。从Invitrogen买了
: 带inducible H1 promoter的vector,叫pENTR/H1/TO,该Vector含
: 一个改造过的H1 promoter,这个promoter中有两个TetO序列,刚
: 刚好夹住TATA box,大致结构如下
: TCCCTATCAGTGATAGAGA C TTATAA G TCCCTATCAGTGATAGAGA
: ------------------- ~~~~~~ -------------------
: 下划线是TetO序列,波浪线标出的是TATA box。
: Invitrogen kit同时包括另一个vector叫plent6/TR,用来表达
: Tet repressor蛋白,当Tet repressor结合到TetO序列上时,就
: 会Block这个H1 promoter,加入Doxycycline能使tet repressor从
: TetO上脱离下来,H1 promoter又可以开始转录。从而实现tet on
: RNAi。
: 我的问题是,我现在有表达rtTA的cell line,如果我把Invitrogen
: 的这个inducible H1 promoter引入到rtTA cell line中会发生什么
: 情况?
: 我的想法是:rtTA是一个包括tet repressor的
: chimeric protein,在doxycycline存在的情况下它应该也能结合到
: TetO序列上,由于两个tetO紧紧夹住TATA box,我猜这个结合应该会
: 阻止H1 promoter的转录,从而实现一个tet off RNAi.
: 虽然rtTA对TRE promoter来说是一个activator。对Invitrogen的inducible
: H1 promoter应该是一个blocker。
: 我这个想法对不对,请熟悉transcription的同学指点一下,多谢了!


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