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从纯化到星辰---CSH蛋白质纯化课侧记(十六)
[同主题阅读] [版面:生物学] [作者:royluo] , 2005年05月30日22:27:57
royluo
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发信人: royluo ( 罗马情结), 信区: Biology
标 题: 从纯化到星辰---CSH蛋白质纯化课侧记(十六)
发信站: Unknown Space - 未名空间 (Mon May 30 22:27:57 2005) WWW-POST


  本文献给YL

(十六)浮起来的细胞膜

  休息了一整天,晚上全体学员和老师去一家sushi店饱餐了一顿生鱼片。第二天
早上,第三个模块的实验开始了。老师是Sue-Hwa Lin,这一个模块是从大鼠肝脏里
面提取胰岛素受体并且做一些鉴定。四个模块的实验之中,我最喜欢这个模块。主要
是因为这是唯一一个设计膜蛋白纯化的实验,而膜蛋白纯化是所有蛋白质纯化中最麻
烦的一类。受体蛋白纯化尤其麻烦,往往可能找不到又快又准确的测活办法。胰岛素
受体即使溶解在去垢剂里面也能与胰岛素接合,所以用简单的binding assay就可以
测活了。相比之下有些受体就不那么好伺侯了,比如我研究的Notch受体,配体也是
膜蛋白,Notch和配体必须都簇集在细胞表面或者固体表面才能有接合,溶液中的游
离状态下根本没法相互作用。
  Sue-Hwa Lin是一个好老师,喜欢在做实验之前详细给我们讲解背景知识,这一
点上她比其他三位老师都做得好。另外她的助手是一位台湾的中年妇女,在Sue-Hwa
实验室做research assistant professor。这位助手特别nice,给我帮助很大。
  好了,现在聊一聊纯化的实验步骤。首先是把大鼠肝脏的质膜部分分离出来,然
后呢用去垢剂溶解一下,用凝集素层析来粗分一下组分,然后做受体测活与鉴定。大
家可能注意到,最后纯化出来的受体只是粗产品。事实上,手册上这个实验里面还得
做一步insulin affinity chromatography来精制一下的。但是最近好多年,很多学员
更希望做一些重组蛋白纯化的实验,所以就把原来的实验给切短了。我觉得这种做法
很不明智,因为重组蛋白纯化的实验实在不需要花几千刀来冷泉港学的。
  细胞膜结构的分离是一门大学问,著名的Methods in Enzymology有专门的一辑
整本都是讲这个的。细胞膜结构主要有核膜,质膜,线粒体,内质网,高尔基体,溶
酶体等等。其中核膜是最容易的,因为细胞核很重,稍微离心一下,就沉淀下来了。
其它的膜结构中呢,线粒体是最重的,质膜由于有胆固醇成分,所以是最轻的。这两
种膜结构也是很好分开的。剩下的膜结构比重比较相似,所以不好分。
  膜结构分离的方法呢,有很多种,但是变来变去,无非都是两种基本方法的组合:
差速离心+蔗糖梯度离心。差速离心(differential centrifugation)是粗分膜结构的
一种常用方法。其实很简单,就是用不同的速度离心三次。首先用等渗缓冲夜来做组织
的匀浆,然后就开始离心。第一次是低速离心,只用600g,这么小的离心力下,只有
未破的细胞和细胞核才会沉淀下来。细胞主要的膜结构以及细胞质都还在上清里面。
拿上清再做第二次离心,这回离心力大了一个数量级,到了8000g。由于线粒体比其
它膜结构要重一些,所以线粒体沉淀下来,而其它膜结构还在上清里面。去上清进行
第三次离心,这回离心力比前一次又要大一个数量级到了十万g。所有的膜结构都会在
此时沉淀下来,所以也包括质膜。需要强调的是,差速离心的分离是非常粗糙的,并不
是十分干净。下一步的蔗糖梯度离心就要精细得多。但不管是什么分离方法,本质上
都不完美,千万不要指望从某篇文章找到一个方法就能套用。最好的办法是利用细胞
膜结构特征性的一些标记物(比如plasma membrane, 测5' nucleotidase 的活性)
来分析分离方法的好坏,并加以改进。
  我们分离质膜用的方法稍微特殊一点,省掉了差速离心这一步。这种方法对于分离
大鼠肝脏质膜比较管用,对别的组织就不一定好用了。我们一组四个人,每人都分了一
个新鲜冰冻的大鼠肝脏(解冻后很难闻),然后就是拿刀片剁啊剁。弄碎了之后就加一
种低渗缓冲液,再把碎的肝脏和缓冲液倒到Dounce匀浆器里面做匀浆。匀浆用的缓冲
液里面加有Ca2+,比较重要。钙离子能够促进质膜碎片的聚集,这样在1500g这样小
的离心力下,质膜也能被沉淀下来。我们把匀浆用两层cheese cloth过滤,去掉了很多
结缔组织。然后就是用1500g离心了。拿出离心管一看,果然有一个很松的pellet,包括
了质膜,细胞核之类的东西。然后再把pellet转移到Dounce匀浆器再弄均匀了。下面
就开始准备蔗糖梯度离心(sucrose gradient)。蔗糖梯度离心是十分古老的一种方法,
但直到现在还有很广泛的应用。我们首先往pellet 匀浆里面加69%的蔗糖溶液,一直到
终浓度变为44%为止。蔗糖的浓度十分的重要,如果不准的话,根本就没法分开。我们
有一个折射仪,可以很快的测出溶液的折射率以及对应的蔗糖浓度。这个折射仪看起来
很粗糙,但是却十分好用。下一步呢,就是把加了蔗糖的匀浆转移到超速离心管里,然
后在上层铺一层42.3%的蔗糖溶液,接着就是超速离心两小时(九万g)。前面提到过,
质膜相比其他膜结构而言是比较轻的,所以呢,在离心的过程中就会浮到上层来。我们
吃罢午饭,就回来看离心管,果然看到一层棕色的东西浮在最上面。这层质膜看起来有
点像果冻,可以用小勺舀出来。到这里质膜的分离就算完成了。     


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