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从纯化到星辰---CSH蛋白质纯化课侧记(二十)
[同主题阅读] [版面:生物学] [作者:royluo] , 2005年06月30日23:55:37
royluo
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发信人: royluo ( 罗马情结), 信区: Biology
标 题: 从纯化到星辰---CSH蛋白质纯化课侧记(二十)
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Jun 30 23:55:37 2005)


本文献给YL


(二十)钙调蛋白

 纯化胰岛素受体的模块结束之后,我们这一组人进入到最后一个模块,
做钙调蛋白的纯化和分析。钙调蛋白(Calmodulin)十分重要,几乎在所有
真核细胞里面都能找到。这个蛋白只有148个氨基酸,大概16KD,比较
小。有Ca2+结合的情况下,钙调蛋白的构象可以发生较大的改变,从而激
活一系列酶的活性,比如cyclic nucleotide phosphodiesterase, 一些
protein kinases, phosphatases 和ATPase等等。这一个模块的实验中,
我们是从鸡胗里面提取和纯化钙调蛋白,然后再做一些分析。

这一个模块的纯化设计,可以说是最大限度的利用了钙调蛋白的特殊
性质,我觉得设计的很精彩。不过我对这个模块的实验经历并不是很满意。
教员的实验助手只有一个人,而且非常不称职,对实验本身似乎不太了解,
也不是很helpful,感觉比前几个模块的实验助手差多了。教员叫Constantin,
是一个俄罗斯人,在rutgers当教授。我起初对他印象不佳,后来发现这个人
其实很nice,非常和蔼。
  
整个纯化步骤大概是这样的。首先把鸡胗剁碎匀浆,然后做粗分离,
用硫酸铵沉淀的办法把杂蛋白都沉淀下来。然后再做等电点沉淀,把
Calmodulin沉淀下来。重溶沉淀之后再做透析来脱盐。然后再过阴离子
交换柱DEAE Sephadex A-50。纯化出来的组分再过疏水作用层析柱,
就可以得到很纯的Calmodulin了,用Commassie blue都可以染出来。

  我们做的实验中没有对Calmodulin的测活实验,可能是因为最后纯化
出来的Calmodulin很多,可以做光谱分析之类的实验进行分析,所以就省
掉了。但我多少有一点本末倒置的感觉。因为对未知蛋白质纯化,首先就得
有一个靠的住的测活方法, 然后才能逐渐制定最优化的纯化策略。另外,
在设计测活方法之前,还必须搞清楚,有生物活性的物质是不是蛋白质。
一般有下列几种方法。(1)对protease的是否敏感。(2)生物活性不会因为透
析而丢掉(3)Urea之类的变性剂是否降低生物活性(4)对化学修饰剂(比如
sulfur hydryl blocker idoacetamide)是否敏感。

我们提取钙调蛋白所用的组织原料,鸡胗,量挺大的,有一斤之多,
红红的一大堆肉。这样的组织,匀浆是一件很麻烦的事情,所以我们用了
一个大号的匀浆机,试图把肉都捣烂。但是效果不好,重复了两次,还是
有很多肉没有被弄碎,所以只好扔掉了。值得强调的是,对于这样大量组
织的匀浆,缓冲液的配方必须有所考虑。首先,离子强度要低一点,高离
子强度容易导致蛋白质聚集和沉淀;其次,最好加如EDTA之类金属离子螯
合剂。这是因为组织里面会有很多二价阳离子,有可能会与组织里面的一
些无机盐(比如磷酸盐)反应产生沉淀,导致匀浆中蛋白质不能完全溶解。
最后,如果要在后续步骤中过阳离子交换柱,要避免有primary amine的
缓冲物(比如tris),如果要过阴离子交换柱,则要避免用磷酸buffer。

我们拿到匀浆之后,然后过滤。接着的一步就是硫酸铵沉淀。硫酸铵
沉淀的原理我前面提到过,所以就不多说了。我们用了饱和硫酸铵浓度
(60%)来沉淀。 钙调蛋白这个东东很奇怪,没有钙离子结合的情况下
很亲水,所以即使用饱和硫酸铵,也沉淀不下来。但大量的杂蛋白都能被
沉淀下来。当然也不是所有的杂蛋白,至少血红蛋白就不行,因为硫酸铵沉
淀后的上清还是红色的。下一步呢,就是等电点沉淀。钙调蛋白是一个很酸
的蛋白,等电点只有4.05,所以可以加硫酸使pH降到4.05附近,蛋白总电
荷为零,就容易聚集沉淀。我的感觉是,等电点沉淀并不是很可靠的方法,
因为很难保证沉淀过程中蛋白会不会变性。搞不好,蛋白沉淀后就没法重溶
了。钙调蛋白溶解性比较好,也比较皮实,重溶起来比较容易。重溶用的是
Tris的溶液,由于这个时候样品溶液里面盐浓度很高,不能直接上样到下一
步的离子交换柱上,所以需要透析。我们先把样品放到蒸馏水中透析两三个
小时,然后再换到一般的缓冲液里。透析大家估计都熟悉,也没有什么技术
含量。只有两点值得注意,首先,透析袋不能装满,因为透析过程中样品体
积会增加。其次,透析袋空的地方要弄瘪,不能留空气,否则样品体积增大
后,扎紧的透析袋可能会受压而破裂。

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